Noavatar Media Player Classic не пользуюсь,но подозреваю,что,возможно,неправильно скрин делаешь.
Например,в
The KMPlayer есть функция "захват кадра" (что дает скрин видео,которое может быть растянуто в данный момент как удобно зрителю,т.е. снимает не оригинал,а то что в данный момент на экране) и есть функция "захват исходного кадра",т.е. оригинальной картинки.
Думаю,и в
Media Player Classic есть подобное